厦门长庚医院儿科系自医院2008年开业以来，在台湾长庚医学中心的全力协助下，厦门长庚儿科系不断发展壮大，科室可以独立开展儿童视频脑电图、儿童支气管镜、儿童消化内镜检查，在提供一般儿科疾病服务的基础上，提供儿童各次专科特色诊疗，如儿童过敏性疾病、儿童哮喘、儿童癫痫、儿童学习困难、抽动障碍、儿童肾脏病、消化系统疾病、儿童先天性心脏病诊疗及介入治疗、新生儿科疾病诊疗、早产儿管理、儿童矮小症、遗尿症等疾病诊疗，科室人员不断追踪医学新进展、精益求精，勤奋严谨、吃苦耐劳，富有爱心，一切为了孩子，提供高品质服务，深受广大民众好评。 
儿科优势： 1.优秀的两岸医疗团队，台籍专家定期支援，两岸医师进行经验交流，保证最优医疗品质。 2.疑难病症跨院区会诊，整合两岸医疗资源。 3.开展次专科特色门诊。 4.长庚医学中心全力支援厦门长庚儿科发展。